視紫紅質 (Rhodopsin)是一種存在於視網膜桿狀細胞（rod cells）
中一種呈玫瑰紅色的視網膜色素，經研究發現它是一種異三合體鳥糞嘌呤核甘酸的結合蛋白(Heterotrimeric
guanine nucleotide-binding protein)；即G蛋白質伴隨受器（G protein-coupled receptors，GPCRs）。
這種蛋白質需要水分子 以及一些其他的物質(包括汞離子、鋅離子、視黃醛等)作為受質(ligand)來協助穩定。
其中有一種稱為視黃醛 (retinal）的受質，對於視紫紅(Rhodopsin)之作用機制有密切關連。視黃醛（retinal）位於視紫紅質的內部，和視紫紅質(Rhodopsin)之間的交互作用十分重要。
視黃醛（retinal）受到光的激發後會由順式(cis-form）轉變為反式(trans-form）
，這樣的形變(comformational change)發動一連串的訊號傳遞反應（signal pathway），最後產生視覺。
研究發現不同生物種體內的視紫紅質(Rhodopsin)在結構上有一些共同的特性：他們都有7個通過細胞膜且鑲嵌於膜上的阿爾發螺旋 （transmembrane α helices），彼此間靠著6個loops連結
。
大致來說，視黃醛(rhodopsin)可分為三個部分， 外細胞部份 （extracellular region）、細胞膜間螺旋 (transmembrane helices)、細胞膜內表面部份 (cytoplasmic surface）。
在外細胞部份(extracellular region)中 Pro23 或 Gln28的side chain的位置很接近S4，S5 strand間的區域和E-I loop上的Tyr102的side chain。這樣的組成會造成很穩定的結構。要是在Pro23 或是Gln28上的突變會導致視網膜病變。
在transmembrane helices（helix2)中，靠近cytoplasmic terminal region幾乎都被一些來自H-II (pro71,leu72),C-II (phe148),H-V (leu226, val230),H-VI (val250, met253)的拒水性residues包圍,形成G protein的binding site。
兩個 Zn ions,3個Hg ions連結於rhodopsin的Asn2、Asn15。11-cis-retinal則由lys296連接 。
11-cis-retinal分為B-ionone ring和retinylidene group兩部分。
Rhodopsin 上的Trp265 支鏈indole ring，指向靠近B-ionone ring的retinylidene group，也靠近retinal的C13-methyl group。
這個C13-methyl group的刪除，在黑暗時造成rhodopsin 的部份 constitutive activity ,失去它和trp265的相互作用.影響整個反應機制的活性。
從B-ionone ring ∼ C11， retinylidene group幾乎和H-III平行，Glu113、 Gly114 ，Ala117、Thr118 ， Gly120、還有Gly121 提供retinal binding pocket很多side chain，主要都在polyene chain的周圍。
Gly90如果被Asp所取代的話
，使其中的salt-bridge 不穩定，會導致夜盲症。 而cytoplasmic surface上的C-IV loop合成許多種的peptides，他們都會影響G-protein的活性。
Conclusion
Rhodopsin的晶體結構有七個很高度組成的transmembrane helices，bundle with 11-cis-retinal，將rhodopsin維持在ground state。
鑑於被11-cis-retinal bound 的rhodopsin有很低的活性，吸收一個光子所產生cis-trans的形變．包含一半蛋白質 、還有細胞質表面的改變，會活化幾百個G-protein 的再生能力，使Rhodopsin active。
一些在細胞質表面的conserved residues，在G-protein活化時，會因為chromophore因光活化，
產生型變，導致rhodopsin活化，使訊號傳遞，因而產生視覺。
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