植物體的主要器官分為根、莖、葉、花及果實

根的橫切面基本上具有一維管組織的中心軸，稱為中心柱(stele)。中心柱外圍是由薄壁細胞組成的皮層，最外圍是表皮組織。根的主要功能是固定、儲存及吸收水分與養分。

莖部組織的排列與植物的年齡有關， 而且單子葉(monocotyledonous)與雙子葉(dicotyledonous)植物的莖構造亦不相同。單子葉植物的莖中，維管束呈束狀排列，散佈在整個薄壁細胞所組成的軸中。幼小的雙子葉植物莖部組織排列較規則，維管束呈環狀排列，包圍住薄壁細胞形成隨，還有薄壁細胞組成的皮層，圍在維管束外，最外圈是一或多層的表皮細胞。

葉是典型薄片狀或是刀刃狀的構造，藉由葉柄與莖相連，葉片表面可分為上表皮與下表皮，包覆著光合作用的薄壁細胞組織，即為葉肉(mesophyll)。大部分的雙子葉植物葉片中，含有兩種形式的葉肉：柵狀組織(palisade mesophyll)與海綿組織(spongy mesophyll)。柵狀組織由一層緊密排列的長形細胞組成，靠近葉片的上表皮，海綿組織則是一堆較鬆散的不規則細胞組成，具有明顯的空隙。