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免疫學家發現熱震蛋白和自體免疫疾病之間可能有關係。一般而言,免疫系統對於自己的組織是不會有免疫反應的,所謂自體免疫疾病便是指免疫系統將自己正常的組織細胞視為外來物,引起免疫反應而造成的疾病。例如,類風溼性關節炎和全身性紅斑狼瘡。在這些自體免疫疾病中,有時可以找到對抗病人體內熱震蛋白的抗體。如果這現象是普遍存在的話,對於自體免疫疾病的診斷和治療將有很大的幫助。
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