Abstract:

             Nuclear factor CREB 刺激目標基因的轉錄需藉著與 coactivator: CBP 的 binding 來
         完成. Binding 是在 CREB 的 KIX domain 與 CBP 的 pKID domain 發生。
             在 complex 形成的過程中,pKID 經歷了一個「coil→helix」的轉變,產生兩個
         αhelices(amphipatic helices)

             CREB 與 CBP的 binding 是一個「 phosphorylation-dependent」的反應。pKID 的 
         phosphoserine(residue 133)的 phosphate group 與 KIX 的 Tyr-658 side chain 形成一個 
         hydrogen bond,幫助 complex 結構的穩定。

        Background:
             Transcriptional activator 調控目標基因的表現。雖然有極少數例外,但大部分的
          activators 都需要 coactivator 的幫忙才能完成它的工作。但即使 coactivator 
         是如此的重要,我們至今對 activator-coactivator recognition 的詳細機制仍然知道的很少。

            CBP:CREB binding protein,CREB 的 coactivator
            CREB:cAMP-regulated transcription factor,與 coactivator(P300、CBP)形成          
                    complex 後能刺激目標基因的 expression。
            KIX、KID:分別為 CBP 和 CREB 的 binding domain。
                    演化上,在各物種中均保有高度的相似性。


        Results and discussion:

            KIX 和 pKID domain 在形成 complex 前後都是以
               不同的 conformation 存在
           Binding前:random coil   Binding後:unique folded conformation

          KIX 與 pKID 的 sequence圖一
            intresting:人造的 KIX(586-679)是 fully folded 的

          pKID 圖二
             
          Methods:Calculated by Interproton distance and torsion angle 
                   restraints derived from multidimensional NMR data. 
                      Table 1......放把火.......
                                                              

          Overall sturcture of the complex: 圖三

          Complex 細部構造:圖四   圖五

          Y658 與 K662 圖六  感動.......:~~

          Comparison to other phosphopide binding problem:
            phosphorylation在cellular signal transduction 中是一種
             十分十分常見的 mechanism. 例如phosphotyrosine 
              containing peptide與SH2 and PTB domain的binding
            但目前對於這種phosphoserine與binding domain間的相關機制
              知道的仍然很少
             相異點
              1.phosphotyrosine 和 basic side chain 作用,且並不只在形成
                hydrogen bond(主要是 electrostatic interaction), 
                也不只在 phosphote group 有作用反觀 pKID 的 phosphoserine,
                其重要性只在產生"一個H.B."
              2.molocule間的binding通常決定於幾個key residues. 
                如 free phosphotyrosine本身就可以binding在SH2 domain,
                 free phosphoserine卻不行
              3.phosphoserine的binding是"sequence specific" , 
                藉著形成hydrophobic groove 來結合
                但缺少那唯一的 H.B. 卻又無法形成complex         





        Conclusion:
             如同早先研究出的 P53 和 VP16,pKID 在 binding to target protein 時,也會經歷一
         個結構上的改變:binding domain 由原本的 unfolded conformation 改變成
         「amphipathic helices」,而促使 binding 的發生。

             由於目前發現許多 transcriptional factor 的 activating region 在未 binding 的狀
         態下也都是 unfolded conformation,因此在未來對這種「folding transition」模式的研究
         將十分重要。同時對 transcriptional factors 的 specificity 和 competing factors 
         的作用機制也應能有更多的瞭解。