GLUCOAMYLASE, GRANULAR STARCH-BINDING DOMAIN

Rasmol script
glucoamylase學名為1,4-D-glucan glucohydrolase， 這種酵素可催化澱粉的水解，故在製酒工業上相當重要 ，它共分為兩個domain，一個是starch-binding domain（residue 509-616，如上圖） ，另外一個則是catalytic domain(residue 1-470)．若是我們可經由其結構得 知其與澱粉作用的主要位置，便可利用分子生物學的方法，改善 glucoamylase與starch bindind 的affinity，進而促進此酵素之作用，而獲得更高的酒精產率




glucoamylase的SBD domain在1996年的時候，已被證明有兩個binding site（Sorimachi et al.,1996）， binding site I如左圖，包括了residue W543, K578, W590, E591, 以及N595









而glucoamylase的binding site II則是由T526, Y527, G528, E529, N530, D554和W554這些residue所組成的，其位置如 左圖：
雖然我們目前已經知道glucoamylase starch-binding domain的主要功能：attatch to granular starch and increase local concentration of the substrate at the active site，但 是關於其細節仍然一無所知，仍有充份的研究空間，等待我們去 發掘