核醣體回收因子(RRF)

身世篇】【個性篇】【相貌篇】【連結篇

barloop.gif (5143 bytes)

【身世篇】

<來源>:Thermotoga maritima (SwissProt, AAD36470)Taxonomy

<resolution>:2.55 A  by multiwavelength anomalous dispersion (MAD)

barloop.gif (5143 bytes)

【個性篇】

成蛋白質時通常可分成三個步驟:起始(initiation)、生長(elongation)和結束(termination)。所謂「請神容易送神難」,在結束時,核醣體(ribosome)的回收是很重要的,而此一步驟即是由RRF和延伸因子G(elongation factor G:EF-G)所催化。對於原核生物更是重要,因為如無RRF,則核醣體會留在mRNA上,就算沒有起使的訊號(initiation signal),也會繼續合成蛋白質。

RRF普遍存在於已知基因組的生物中(除了Archaea);T. maritima RRF 和酵母菌的tRNA 有很相似的四級結構(想知道有多像嗎?),因此推測RRF和tRNA一樣,會去與 posttermination ribosomal complex作用,並使其分解。

RRF有兩個domains:

termination時,release factors(RF1或 RF2)會水解 peptidyl-tRNA並釋出新合成的 peptide;於是mRNA、空的 A-site和有 deacylated tRNA 的P-site的70S ribosome會形成 posttermination complex。然後RRF會結合至A-site,接著EF-G 會使RRF從A-site位移至P-site(主要作用的部份),使得原來在P-site的 tRNA被打入冷宮移至E-site,最後黯然離開核醣體;而當RRF和EF-G離開核醣體時,失去tRNA靠山的mRNA也就離開了。這一連串反應所需的能量則是來自水解GTP而來的。

upnext.gif (23556 bytes)

barloop.gif (5143 bytes)

【相貌篇】

mode

color

  cartoon   structure
  backbone   chain
  spacefill   group
  wireframe   charge

  ligands

  ACY 280
  ACY 281
  water
  hydrogen bonds

upnext.gif (23556 bytes)

barloop.gif (5143 bytes)

【連結篇】

secondary structure plot
Crystal Structure of Thermotoga maritima Ribosome Recycling Factor: A tRNA Mimic
Maria Selmer, Salam Al-Karadaghi, Go Hirokawa, Akira Kaji, and Anders Liljas
Science 1999 December 17; 286: 2349-2352. (in Reports)
PDB#1DD5
tRNA(Yeast, Phe):PDB# 4TRA
70S ribosome(with P site,A site,E site):PDB# 486D

upnext.gif (23556 bytes)

barloop.gif (5143 bytes)

back to homenext.gif (23556 bytes)