在翡翠水庫之生態模擬系統中，大致可分為五條能流路徑：

1. 植物性浮游生物＝＞草食性魚類＝＞肉食性魚類
2. 植物性浮游生物＝＞雜食性魚類＝＞肉食性魚類
3. 植物性浮游生物＝＞小型雜食性魚類＝＞雜食性魚類＝＞肉食性魚類
4. 植物性浮游生物＝＞小型雜食性魚類＝＞中型雜食性魚類＝＞雜食性魚類＝＞肉食性魚類
5. 植物性浮游生物＝＞動物性浮游生物＝＞小型雜食性魚類＝＞中型雜食性魚類＝＞雜食性魚類＝＞肉食性魚類