Homework1

DDBJ 是一個由日本所提供的DNA資料庫,主要收集的是,日本學者研究出來的序列,當然也包含了其他各國的可信資料。使用DDBJ可以同時搜尋EBI和NCBI的資源。它所提供的服務,除了DNA,protein的序列查詢之外,有相關的分析軟體,另外還能夠比對序列的homology。SRS功能,可以鍵入關鍵字,同時搜尋兩個以上的資料庫,減少花費的時間,增加準確度。若是所要輸入的資料太過龐大,也可以按照Mass Submission System (MSS)的指示來登錄。但是由於是日本的資料庫,有些網頁文字只有日文顯示,這可能是個比較不便之處。

LIBRA I
http://www.ddbj.nig.ac.jp/E-mail/clustalw-e.html

LIBRA I 是"LIght Balance for Remote Analogous proteins, ver. I",它的功能是evaluates the compatibility of a protein structure and a sequence。這個軟體的使用非常容易,並不需要學會任何的程式語言,只要在線上,按照表格的要求,最基本的,是必須輸入所想要檢查的蛋白質序列(使用大寫,標明每一個胺基酸的單一字母縮寫),並且填好自己的e-mail address,就能夠在一天之後,收到答案。是個容易而方便使用的軟體。