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將MLH1(ACCN:BC005866)的sequence拿去做BLASTn.
在Options for advanced blasting中,在Limit by entrez query中填入 mutS[GENE] AND Escherichia coli[ORGN]
結果只有一項符合,那就是我們要找的E. coli(ACCN:NC_000931).
點選查看詳細的資料.
將GenBank改成FASTA,再按,就看到sequence啦!! (不過檔案非常大唷~)
或者按,存成txt檔.
這個找到的 sequence 是 complete genome,那麼我們要找的 mutS 在那裡呢?
E. coli K12的GenBank file裡,用網頁搜尋,找keyword:mutS.
只有一個gene符合.
看詳細的資料.
下面有sequence,也可以換成FASTA format.
在最下面還可以直接做 BLAST.
可惜的是記下ACCN去Entrez查並不能直接查到這個檔案,所以只好用複製貼上的方法來存檔囉~~

Download the complete genome of E. coli K12(ACCN:NC_000913)
or the partial sequence of mutS.



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