種苗產業具有資本、技術密集，產值高、單價高之特性，適合我國小農結構、技術密集之環境，極可能成為我國未來加入ＷＴＯ後較具發展潛力之重點產業項目之一。

政府大力推動知識經濟發展，提供農業轉型契機，而國內植物組織培養技術優異，各學研機構與業界多擁有豐富知識與經驗，已掌握競爭利基，例如：蘭花類組培苗外銷產值正逐年上升。

高科技基因工程及細胞培養技術人才眾多，水準甚高，且新一代農民均受良好教育，素質整齊，易接受新知，當為國內發展生技產業之雄厚基礎。

新興作物種類與品種及產銷資訊仍不足，亟需加強開發並建立種苗管理制度與產銷資訊服務體系。

可創造重大商機之技術平台甚為有限，亟需寬籌經費，加強關鍵性技術之研發。

農、園藝作物育種改良時程較長，智財權保護及生物安全性管理等規範亟待落實。

運用台灣本身擁有之地理和氣候條件，積極發展具本土特色之亞熱帶植物種苗，可與國外環境與產品區隔，進軍國際市場。

台灣農業策略聯盟成立，種苗產業可結合同業及異業團體，推動統合經營制度，降低產銷成本，發揮整體經濟效益。

國內大多數業者經營規模較小且不具研發能力，加入WTO後，相關業者未來之利潤空間將壓縮，恐影響業者投資意願。

台商赴大陸生產同質性具競爭潛力之植物種苗產品，恐打擊國內科技研發之實際成效。